Forntida sköldpadda avslöjar tropiskt DNA

Den fossila skallen på den bahamiska sköldpaddan, som gav det första gamla tropiska DNA: t. Foto med tillstånd av Nancy Albury viaUF Nyheter.
En nu utrotad bahamansk jättesköldpadda som trillade ner i ett kalkstenshål för 1000 år sedan har gett det första provet av forntida DNA som hämtats från en utdöd tropisk art. Använda varelsenshumerus, eller ben i den övre frambenen, kunde forskare rekonstruera ett nästan fullständigt mitokondriellt genom hos sköldpaddan,Chelonoidis alburyorum.MedförfattareDavid Steadman, en ornitolog vidUniversity of Florida, sa i en 7 februari 2017påstående:
Detta är första gången någon har kunnat sätta in en tropisk art i ett evolutionärt sammanhang med molekylär data.
Och att kunna passa ihop sköldpaddans evolutionära historia tillsammans hjälper oss att bättre förstå dagens tropiska arter, varav många är hotade.
Arbetet gör att laget kan kontextualisera historien om de karibiska tropikerna och ge dem en ny syn på hur livet utvecklats där. Studien varpubliceradifackgranskad Förfaranden från Royal Society B.

Sköldpaddan hämtades från Sawmill Sink, ett djupt blått hål på Bahamas. Foto av Brian Kakuk viaUF Nyheter.
Den sällsynta skelettfyndigheten möjliggjordes av den unika kemiska sammansättningen av det vattenfyllda sinkhålet där skalle, skal och andra fragment hittades. Sågverksfatet på Abaco Island är skiktat och saknar syre. Bristen på syre avskräcker nedbrytning och bevarar fossil. Andra jättesköldpaddor har hittats i sinkhålet, även om DNA -testning på de andra inte har utförts än. Steadman sa:
De två sakerna som är riktigt bra för långsiktigt bevarande av DNA är kyla och torrhet. Och tropikerna ger vanligtvis ingen.
Efter att ha hämtat sköldpaddan från Sawmill Sink, ett djupt blått hål på Bahamas med branta vertikala väggar, fann dykare inte bara skalet intakt utan hela skelettet. Bahamas sköldpadda innehöll benkollagen, ett protein som, när radiokolvet daterades, gjorde det möjligt för forskare att uppskatta att arten utrotades för bara 780 år sedan - strax efter ankomsten av mänskliga bosättare i området.
Forntida DNA från utdöda arter under den senaste istiden - Pleistocene och Holocene epoker - ger värdefulla evolutionära insikter, men tropiska fossiler - särskilt intakta - är sällsynta fynd. Steadman förklarade:
I fossilregistret beskrivs så många arter bara från några få fragment som finns, och även om det är mycket bättre än ingenting, får du inte karaktärisera hela critteren.
Med den här sköldpaddan, ja, här är den.

En 3D-modell av plast skapad av den gamla sköldpaddens skal vilar lätt i två händer, ungefär lika stor som en fotboll. Bettmärken från krokodiler och andra rovdjur syns på ytan. Bild viaUF Nyheter.
Sammanfattning: En gammal jättesköldpadda som trillade ner i ett sinkhål för 1000 år sedan har gett forskare en sällsynt titt på tropiskt DNA.